Заповедник Амбатоваки расположен между реками Симианона и Маримбона и простирается на 60 050 гектаров в округе Соаньера-Ивонго северо-восточной оконечности Мадагаскара. Заповедник обычно классифицируют как влажный тропический лес. Здесь много различных форм ландшафта: в заповеднике есть хребты, долины и холмы, покрытые лиственными деревьями. Встречаются также и склерофиты.
Заповедник Амбатоваки основан 28 октября 1958 года. Сейчас он стал центром научных исследований благодаря изобилию эндемиков. Редкие представители фауны и были изначальной причиной, почему открыли заповедник.
Защитники природы выделяют заповедник Амбатоваки как критически важное место для птиц, находящихся под угрозой исчезновения. Только здесь обитают очень редкие виды птиц, например, краснохвостая ньютония и мадагаскарский зимородок. Когда в 1989 году на территории Амбатоваки обнаружили краснохвостую ньютонию, её к тому времени уже считали вымершим видом. Заповедник также является домом для таких птиц, как белогрудый мадагаскарский пастушок, одноцветный мадагаскарский пастушок, мадагаскарская база, мадагаскарский сорокопутовый личинкоед и одна из самых редких в мире хищных птиц — мадагаскарский змееяд. До того, как его заметили в заповеднике Амбатоваки, последний раз его видели лишь в далёких 1930-х гг.
В Амбатоваки обитает около 125 редких сифак Перье, которым Международный союз охраны природы присвоил статус «в критической опасности». Их описывают как одних из самых таинственных лемуров на Мадагаскаре з-за их необычного внешнего вида, в частности очаровательных глаз с красновато-оранжевым оттенком. Интересный факт о сифаках Перье: хотя их рацион в основном состоит из цветов, фруктов и листьев, иногда они употребляют в пищу и почву. Учёные предполагают, что так они дополняют свою диету минералами. В заповеднике также можно встретить индри, рыжебрюхих лемуров, лемуров вари. Помимо птиц и лемуров, здесь также есть 221 вид растений, 113 видов амфибий и рептилий.
Основные источники воды для растений и животных заповедника — реки Ямпирано и Сандрангато. В этих реках обитает 34 вида рыб. Здесь часто охотятся фаналуки и фоссы.
Заповедник Амбатоваки — одно из лучших мест для хайкинга и бёрдвотчинга для тех, кто хочет увидеть мир природы во всей его красе.
На окраинах заповедника проживает 29 489 человек из 57 деревень и коммун. Большинство из них — из племени Бецимисарака.